La Comisión Delegada tiene como Presidente al Gerente del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla. Entre sus funciones están realizar un seguimiento periódico de las tareas de dirección y de gestión del centro, realizar el seguimiento de los convenios y acuerdos suscritos por la Fundación y facilitar las tareas de dirección y gestión de la Fundación, especialmente en lo relativo a sus relaciones con las entidades fundadoras
Composición:
Presidente: D. D. Julio Pascual Gómez. Director Gerente del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla.
- Dª. María de la Cruz Gemma Reguera Andrés. Secretaria General. Consejería de Sanidad.
- D. Javier León Serrano. Vicerrector de Investigación y Transferencia del Conocimiento. Universidad de Cantabria.
- Dª Maria Antonia Mora González. Directora General de Ordenación y Atención Sanitaria. Consejería de Sanidad.
- D. Jose Antonio Riancho Moral. Jefe de Sección. Servicio de Medicina Interna. Hospital Universitario Marqués de Valdecilla.
- D. Luis Martínez Martínez. Jefe del Servicio de Microbiología. Hospital Universitario Marqués de Valdecilla. Profesor Titular del Departamento de Biología Molecular. Universidad de Cantabria.