De acuerdo con los estatutos del IDIVAL publicados en el Boletín Oficial de Cantabria de 13 de Enero de 2014, el Patronato es el máximo órgano de gobierno del IDIVAL y cuenta con el mayor nivel de representación encontrándose presidido por el Consejero de Sanidad. Entre sus funciones se encuentran la aprobación del presupuesto anual y del plan estratégico del Instituto así como el nombramiento de los directores y de los miembros de los órganos asesores.
Presidente: D. César Pascual Fernández. Consejero de Salud.
Vicepresidenta: Dª María Concepción López Fernández. Rectora de la Universidad de Cantabria.
Vocales:
Secretario:
La Comisión Delegada tiene como Presidente al Gerente del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla. Entre sus funciones están realizar un seguimiento periódico de las tareas de dirección y de gestión del centro, realizar el seguimiento de los convenios y acuerdos suscritos por la Fundación y facilitar las tareas de dirección y gestión de la Fundación, especialmente en lo relativo a sus relaciones con las entidades fundadoras
Presidente: Felix Rubial Bernardez. Director Gerente del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla.
El Director de Gestión actúa como representante y portavoz de la Fundación ante las instituciones en lo que respecta a las actividades de gestión, gestionando la organización interna del Instituto y su infraestructura de investigación. En la actualidad, el director de gestión de IDIVAL es el Dr. Galo Peralta, Especialista en Medicina Interna y Máster en Gestión Sanitaria.
El Director Científico actúa como máximo representante y portavoz de la Fundación, en materia científica, dirige, planifica y lidera la política científica de la Fundación, elabora el plan científico del Instituto y coordina su desarrollo. En la actualidad, el director científico de IDIVAL es el Dr. Marcos Lopez Hoyos, Jefe del Servicio de Inmunología del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla.
